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审计成本控制是通过合理配置资源，力求以最小的审计成本最有效地实现审计目标的一种控制手段。通常，审计成本包括完成审计工作需花费的资金成本、人力成本和时间成本。对于一项审计工作来说，如果需要人员多、耗费时间长，其所需的资金成本及总的审计成本就比较高；反之则审计成本较低。在实践中，我们可以通过分析审计成本的影响因素，选择采取多种方式降低审计成本。
严格控制审计程序，尽量减少中间环节
审计程序是指审计工作的先后次序，也就是审计机构和审计人员为达到审计目标采取的所有工作步骤的总和。审计程序既是保证实现审计目标的手段，也是审计成本的直接决定因素。审计程序越繁琐，审计成本就越高，可能导致的审计资源的不必要的浪费就越严重。所以，要降低审计成本，必须严格控制审计程序。
根据审计机关工作的性质，审计程序可分为审计管理程序和审计执法程序。审计管理程序是对审计管理工作中事务处理流程的描述与规定，是处理审计日常事务的例行办法。审计执法程序是指审计机关对审计事项进行审计的全过程，也称项目审计程序。在实践中，由于审计资源的限制，审计机关必须在保证最佳资源配置的前提下，慎重选择最恰当的审计程序。为实现有效的程序控制，必须遵循以下原则：一是要从审计工作整体发展要求出发去分析和设计审计程序，避免重复交叉。审计行政管理工作往往会涉及多个职能部门、工作岗位、主管与专业人员，以及各类管理活动，如调研、计划、审核等；还会涉及到各种各类的具体审计业务，因此，应将审计程序作为一个系统，将各种程序的重复、交叉与矛盾减少到最低限度。二是要保证审计程序的计划性，促进程序的有效运行。从本质上讲，程序也是一种计划，进行程序设计必须充分考虑其必要性、可否收到预期效果以及是否有助于实现计划等问题。同时还要促进程序的运行，如汇编有关程序的规定，培训、指导员工进行正确的程序操作，确保员工可以及时、正确地接受新的程序，并按照预期要求工作。三是要评估程序运行所需费用，简化审计程序。
优化审计组织，整合审计资源审计资源的利用状况直接决定着审计成本的高低，所以，加强审计的组织与管理，促进现有审计力量与审计对象的最佳结合，也是审计成本控制的重要手段。在审计计划管理工作中，优化审计项目组织工作、促进审计资源整合的手段主要有：一是计划安排要明确目标，突出重点。根据审计工作发展目标和有效实施审计监督的需要，在计划安排上要突出重点，明确年度审计工作总体目标和各项目审计目标；在保持各专业审计优势的基础上，科学调整内部机构设置，合理调配审计力量，加强审计署各专业司与派出机构及下级审计机关的协调配合，充分发挥审计监督的整体优势。
二是加强对统一组织审计项目的管理，全面深入把握被审计对象或事项的情况。对某些事关国民经济全局的项目或资金组织全行业、全系统或全国范围内的分层次审计，是整合审计资源的重要手段。一方面，有利于从全局上系统地掌握情况，反映普遍性问题；另一方面，有利于提高审计报告的全面性和针对性，给政府决策提供大量的、全面的、系统的材料。这样，在无需增加审计资源和力量的情况下，也能从更高层次上、更加深入地发挥审计监督的作用。
三是审计与审计调查相结合，注重发挥延伸审计或调查的作用。同审计相比，审计调查具有形式多样、程序灵活、花费精力和时间少、掌握情况多等特点，但审计调查也存在着深度不够、不处理处罚影响监督力度等缺点。在当前审计力量不足的情况下，根据被审计单位情况，在计划安排上加大审计调查力度，对于扩大审计监督覆盖面具有很重要的作用。在一些项目审计过程中，对重点问题进行重点审计，对其他一些问题和单位进行延伸审计或调查，也可以在不影响审计质量的前提下，起到节约审计力量的作用。
四是在不影响独立性的前提下，项目安排要尽可能就地就近。长期以来，为了保证审计的独立性，审计署对驻各地特派员办事处的审计项目安排，多采用异地交叉方式。异地交叉审计大大增加了审计外勤费用，而且由于被审计单位对审计人员来说都是全新的部门，有很多不熟悉的情况和问题需要去了解，客观上也增加了审计成本。所以，在不影响独立性的前提下，应尽可能安排就地就近审计。
五是灵活采用就地审计与送达审计方式。就地审计与送达审计是两种不同的审计方式。与就地审计相比，送达审计可以使有限的人力资源和各种潜在的审计信息资源得到更为充分、有效的利用，有利于提高审计质量。所以，在审计计划安排时，科学分析项目特点，灵活采用送达审计方式，对降低审计成本也具有重要的作用。
开发利用审计成果，合理转嫁成本
从费用效益的角度分析，审计成本还可以通过审计成果体现出来。也就是说，加强审计成本控制，还可以采用合理转嫁成本的方式，促进审计资源的充分利用。
一是要注重审计成果的综合利用。首先，审计成果集中体现在审计报告上，要提升审计成果的层次和水平，就必须提高审计报告质量；第二，要强化审计信息工作，提高信息的时效性和针对性，实现审计信息资源共享，更好地为领导决策服务；第三，要实行审计结果公告制度，对所有审计和审计调查项目的结果，除涉及国家秘密、商业秘密及其他不宜对外披露的内容外，全部对社会公告，实现审计信息（成果）的社会共享和利用的最大化。
二是建立审计结果跟踪落实制度。审计不仅要查出问题，还要促进问题的解决落实。所以，加强审计成本控制，还要强化对审计决定和审计意见落实情况的跟踪检查，做到查出一个问题，就处理解决一个问题。
强化预算控制，降低费用支出预算作为一种控制手段，属于计划的范畴，是对未来一定时期内收支情况的预计。对国家审计机关来说，预算主要是指对一定时期内审计经费及机关行政经费收支情况的预测。审计经费是由审计项目决定的，行政经费则是由审计日常公务活动和审计人员决定的。根据国家财务制度规定，强化预算控制主要采取以下方式：一是实行定额预算。定额预算是预算管理的最主要形式。目前，国家统一对机关行政经费实行定额定员管理，也就是由人员定预算，由预算定经费，由经费定支出，这对强化预算约束起到了重要作用。审计机关对审计经费的管理也可以比照上述方法，实行定额预算，由项目定人员、定时间，由人员和时间定工作量，再由工作量定经费，这样在年初制定计划的同时，就相应编好了经费预算。另一方面，为了加强预算编制的科学性，可以根据审计工作经验，分别项目的性质、类型、规模等实行定额管理，减少预算编制中的人为因素，这样在保证计划科学性的同时，也实现经费使用的计划性和科学性。
二是建立节约奖励制度。节约奖励制度是定额预算的配套措施。审计项目的多样性和不可测性，给定额的确定带来很大困难，而且对于一些较为复杂或有较强变化性的审计项目，就是年初制定了预算，随着项目审计的推进也难免会造成预算的追加追减，这样很容易使预算流于形式。所以，对于一些特殊的审计项目，可以采取经费包干、节约奖励的方式。
